了解了二次编译过程，有些人会问：为什么不直接将ASP.NET程序源代码直接编译称为机器代码存放在服务器上，而要先将其转换为MSIL这种之间代码？要想了解这个问题必须要知道将MSIL代码转换为机器代码的JIT编译器。
CLR针对其支持的各种系统结构提供一个或多个JIT编译器，依赖于运行在各种系统结构上的JIT编译器，MSIL就能被编译成为各种不同的机器代码，以适应对应的系统平台，最终使得程序在目标系统中得到顺利地运行。这意味着MSIL能够跨平台执行。当然跨平台的前提是CLR支持这种平台（目前仅支持Windows），不过微软正在积极行动，试图将CLR移植到许多主要的平台中去。
